144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4239 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6433  Serine/threonine protein kinase-like protein  49.31 
 
 
878 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00642211  normal  0.0697587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0532  serine/threonine protein kinase  58.29 
 
 
853 aa  954    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.332532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3610  serine/threonine protein kinase  51.16 
 
 
866 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.561944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4239  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
870 aa  1743    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1322  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 
854 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7441  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.29 
 
 
873 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4731  serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 
839 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4848  serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
880 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1744  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
860 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00380667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7172  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
861 aa  257  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0246  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
896 aa  241  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2130  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
894 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0710537  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4758  serine/threonine protein kinase, putative  23.21 
 
 
838 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000666058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2549  Serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 
614 aa  126  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1920  hypothetical protein  26.39 
 
 
719 aa  115  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0598  serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
864 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2497  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 
880 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0376  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
865 aa  97.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0417  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
412 aa  64.3  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
486 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.96 
 
 
602 aa  61.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
861 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0204  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
679 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.998646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
507 aa  58.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.74 
 
 
696 aa  58.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
855 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
450 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2732  serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
563 aa  55.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.420393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  27.65 
 
 
457 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 
517 aa  54.3  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1995  Serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 
560 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
416 aa  54.3  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 
505 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  22.41 
 
 
416 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  28.08 
 
 
481 aa  53.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.87 
 
 
614 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
526 aa  53.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
479 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
652 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
457 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  28.98 
 
 
746 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
479 aa  52.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
573 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  22.41 
 
 
718 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.65 
 
 
598 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  28.57 
 
 
651 aa  52.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2518  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
275 aa  52.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 
651 aa  51.6  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  19.32 
 
 
713 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
328 aa  51.2  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2051  serine/threonine protein kinase  20.18 
 
 
429 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0809691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  29.27 
 
 
762 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.81 
 
 
662 aa  50.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
285 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
571 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7263  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.69 
 
 
594 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000272389  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2542  serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
447 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0220  Serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
702 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000803094  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 
468 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  27.78 
 
 
574 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  27.32 
 
 
571 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  20.91 
 
 
666 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5817  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 
384 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
636 aa  50.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
842 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1846  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
558 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0154995  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1415 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
338 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
623 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  26.03 
 
 
623 aa  48.9  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  26.01 
 
 
623 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2462  protein kinase  28.74 
 
 
499 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  26.01 
 
 
621 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.81 
 
 
659 aa  48.9  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3576  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
473 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
754 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
774 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  26.36 
 
 
519 aa  48.9  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.64 
 
 
662 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  31.36 
 
 
567 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2109  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  24.54 
 
 
777 aa  48.5  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2172  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
509 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  26.82 
 
 
329 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
565 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
691 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
721 aa  48.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  23.61 
 
 
647 aa  48.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  27.6 
 
 
403 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  26.75 
 
 
484 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0235  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 
284 aa  47.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
396 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  23 
 
 
625 aa  47.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  25.79 
 
 
430 aa  47.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
481 aa  47.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
554 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
483 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4371  serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 
634 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.690427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 
531 aa  47.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
602 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>