35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4050 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  100 
 
 		 857 aa  1727    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  28.12 
 
 		 861 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  22.52 
 
 		 834 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  29 
 
 		 701 aa  124  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  23.71 
 
 		 520 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  23.03 
 
 		 845 aa  122  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  25.47 
 
 		 859 aa  112  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  27.48 
 
 		 840 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  20.97 
 
 		 847 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  23.45 
 
 		 829 aa  100  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.47 
 
 		 921 aa  54.3  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1479  helicase c2  28.4 
 
 		 750 aa  52.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0418794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1819  helicase c2  28.02 
 
 		 749 aa  51.6  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.414686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1795  helicase c2  28.02 
 
 		 749 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6284  helicase c2  28.02 
 
 		 749 aa  51.2  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5096  helicase c2  28.02 
 
 		 748 aa  51.2  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334397 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  23.01 
 
 		 832 aa  50.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1733  helicase c2  27.24 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336556  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  26.86 
 
 		 757 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1706  helicase c2  27.24 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  26.67 
 
 		 755 aa  47.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  26.88 
 
 		 752 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  30.63 
 
 		 635 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  26.88 
 
 		 752 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  26.88 
 
 		 752 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  26.88 
 
 		 752 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  26.88 
 
 		 752 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2336  ATP-dependent helicase, putative  26.88 
 
 		 752 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  26.48 
 
 		 749 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  26.09 
 
 		 751 aa  46.6  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  26.01 
 
 		 659 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  26.88 
 
 		 755 aa  46.2  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  26.19 
 
 		 1183 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.03 
 
 		 960 aa  45.8  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  27.35 
 
 		 713 aa  45.8  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>