30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3997 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  62.07 
 
 		 148 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  56.57 
 
 		 126 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  56.12 
 
 		 117 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  45.71 
 
 		 138 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  46.32 
 
 		 106 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 109 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 106 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 103 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  42.17 
 
 		 102 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  46.91 
 
 		 108 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  48.19 
 
 		 95 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  48.68 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  33.71 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 111 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  33.73 
 
 		 111 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  32.61 
 
 		 106 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 111 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1403  RNA-binding protein  62.16 
 
 		 49 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0287  hypothetical protein  49.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2996  hypothetical protein  65.85 
 
 		 120 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3379  hypothetical protein  49.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2989  hypothetical protein  56.76 
 
 		 57 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3345  hypothetical protein  53.85 
 
 		 108 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2373  hypothetical protein  65.85 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0547  hypothetical protein  53.66 
 
 		 122 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>