16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3557 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.18 
 
 
213 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  33.5 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  30.49 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  29.28 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.17 
 
 
747 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.14 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.67 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.87 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  31.85 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.14 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  24.5 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
531 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.06 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  24.62 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.75 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>