35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3305 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3305  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0166  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.16 
 
 
134 aa  157  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0189  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.574477  hitchhiker  0.00262088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3520  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.09 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5532  hypothetical protein  48.41 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353133  normal  0.762952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4615  hypothetical protein  45.24 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5923  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.52 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3180  hypothetical protein  35.56 
 
 
141 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2887  hypothetical protein  36.3 
 
 
142 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2388  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.8 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0476612  normal  0.436091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0254  hypothetical protein  38.21 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1646  hypothetical protein  39.84 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169388  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.743338  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0978  hypothetical protein  38.89 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0400568  normal  0.0270186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0313  hypothetical protein  36.29 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.783426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7081  hypothetical protein  33.83 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1038  hypothetical protein  33.85 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8404  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.54 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97224  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0837  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
122 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1536  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354467  normal  0.0455127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0477  hypothetical protein  30.7 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0871  hypothetical protein  35.38 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.325277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6380  hypothetical protein  30.66 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7787  hypothetical protein  32.03 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.955905  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11910  hypothetical protein  35.16 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4353  hypothetical protein  32.54 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00239214  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2790  hypothetical protein  32 
 
 
237 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0512113  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000699293  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5593  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0692  hypothetical protein  32.81 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1113  hypothetical protein  35.14 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25510  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  33.04 
 
 
121 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>