16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2836 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  41.12 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  44.85 
 
 
172 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  41.46 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  32.23 
 
 
280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  39.1 
 
 
209 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  41.98 
 
 
283 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  39.13 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  35.9 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  40.78 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  33.54 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  33.54 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  29.88 
 
 
221 aa  58.9  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  29.29 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0217  hypothetical protein  34.15 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.745262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1923  excinuclease ABC subunit C  30.86 
 
 
557 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0236907  normal  0.0335475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>