16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1861 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  40.1 
 
 
218 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  37.56 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  39.36 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  40.93 
 
 
220 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  44.3 
 
 
172 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  43.03 
 
 
183 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  55.56 
 
 
175 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  34.34 
 
 
209 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  29.36 
 
 
220 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  29.36 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  30.92 
 
 
221 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  29.95 
 
 
221 aa  89  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1923  excinuclease ABC subunit C  31.31 
 
 
557 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0236907  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0212  hypothetical protein  35.29 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>