16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2381 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  383  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  43.05 
 
 
172 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  42.58 
 
 
218 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  38.96 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  40.26 
 
 
280 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  43.03 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  43.55 
 
 
283 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  40.65 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  41.06 
 
 
220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  47.47 
 
 
175 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  27.92 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  27.92 
 
 
220 aa  61.6  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  28.21 
 
 
221 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  27.56 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1923  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 
557 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0236907  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3969  group I intron endonuclease  25.97 
 
 
561 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>