19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1595 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  592  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  35.29 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  39.36 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  34.74 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  43.55 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  36.88 
 
 		 172 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  32.13 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  42.52 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  32.13 
 
 		 220 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  32.02 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  49.46 
 
 		 175 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  31.03 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  34.94 
 
 		 209 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  34.21 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5472  hypothetical protein  33.64 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1923  excinuclease ABC subunit C  32.18 
 
 		 557 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0236907  normal  0.0335475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1891  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3969  group I intron endonuclease  31.58 
 
 		 561 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182947 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0212  hypothetical protein  39.29 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>