21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2133 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 
78 aa  158  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1196  hypothetical protein  50.67 
 
 
73 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2769  hypothetical protein  41.1 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2694  hypothetical protein  36.11 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00619156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
223 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.94 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  36.67 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  31.91 
 
 
97 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  44.62 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  39.44 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  40 
 
 
65 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.1 
 
 
349 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  35.21 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  35.21 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  35.21 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  44.07 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1470  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
62 aa  40  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>