29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1301 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  36.06 
 
 		 349 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  39.82 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  31.34 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  30.09 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  31.48 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  31.48 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  28.7 
 
 		 409 aa  67  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  29.19 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  31.61 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  31.79 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  32.41 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  26.07 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  26.45 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  27.49 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  29.11 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  29.67 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  28.08 
 
 		 432 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  25.73 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  26.09 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  29.17 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  26.76 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  26.54 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  25.24 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  27.37 
 
 		 408 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  21.16 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  28.16 
 
 		 428 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>