17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0509 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0509  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 607 aa  1206    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466068  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3707  hypothetical protein  37.56 
 
 		 573 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.632256  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0187  TrkA domain-containing protein  32.24 
 
 		 653 aa  223  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.390007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0415  TrkA-like  29.13 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0668  hypothetical protein  38.31 
 
 		 838 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.800036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1166  hypothetical protein  39.16 
 
 		 211 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0168767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0414  putative ryanodine receptor  44.33 
 
 		 101 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.425505  normal  0.313616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08520  hypothetical protein  33.54 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  0.0343131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  34.21 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1462  hypothetical protein  23.93 
 
 		 917 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4293  hypothetical protein  30.18 
 
 		 789 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4215  TrkA-N domain protein  25.67 
 
 		 428 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  37.63 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 		 347 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  28.41 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  24.06 
 
 		 346 aa  43.9  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  19.42 
 
 		 564 aa  43.5  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>