More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3593 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3593  putative glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  100 
 
 
436 aa  905    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3708  putative glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  66.13 
 
 
463 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2366  aminotransferase class-III  50 
 
 
438 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0569  aminotransferase class-III  39.67 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6410  aminotransferase class-III  39.39 
 
 
444 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0624  aminotransferase class-III  34.88 
 
 
448 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0291  aminotransferase class-III  32.44 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000819224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.18 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.63 
 
 
429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3749  aminotransferase class-III  33.1 
 
 
445 aa  252  7e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.12 
 
 
426 aa  252  9.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.52 
 
 
426 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.24 
 
 
424 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
432 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0133  aminotransferase class-III  34.86 
 
 
431 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1726  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.49 
 
 
420 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36 
 
 
417 aa  246  8e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4475  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.93 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.24 
 
 
427 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.94 
 
 
433 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.79 
 
 
439 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.56 
 
 
433 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1413  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.88 
 
 
430 aa  240  4e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.190145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.05 
 
 
432 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.41 
 
 
427 aa  239  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.03 
 
 
432 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1717  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.02 
 
 
441 aa  239  8e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.189585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.1 
 
 
422 aa  239  9e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.56 
 
 
422 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.58 
 
 
427 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.08 
 
 
427 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.26 
 
 
434 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
428 aa  237  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.33 
 
 
427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.41 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.18 
 
 
433 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.18 
 
 
433 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.64 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.71 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.155106  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.64 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.76 
 
 
427 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1162  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.61 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.467578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2017  aminotransferase class-III  37.08 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.33 
 
 
413 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.71 
 
 
432 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.18 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.18 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.11 
 
 
428 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.5 
 
 
427 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  33.18 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.18 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.1 
 
 
428 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1970  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.72 
 
 
444 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.463267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2622  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.56 
 
 
445 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
426 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
426 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.42 
 
 
626 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.34 
 
 
427 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
426 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  32.19 
 
 
452 aa  230  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.95 
 
 
426 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.95 
 
 
426 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.71 
 
 
432 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.74 
 
 
433 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0185  aminotransferase class-III  36.8 
 
 
448 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.74 
 
 
431 aa  230  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0485  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30 
 
 
431 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.36 
 
 
425 aa  229  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.93 
 
 
429 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
428 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  31.92 
 
 
430 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.25 
 
 
437 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.58 
 
 
428 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.73 
 
 
437 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.2 
 
 
429 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.74 
 
 
428 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.2 
 
 
429 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.67 
 
 
429 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.1 
 
 
432 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.25 
 
 
453 aa  227  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1293  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.48 
 
 
438 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.66 
 
 
433 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1231  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.34 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.250088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.64 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.26 
 
 
426 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.19 
 
 
429 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2560  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.86 
 
 
417 aa  226  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2065  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.1 
 
 
438 aa  226  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870118  normal  0.0113612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.72 
 
 
426 aa  226  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.81 
 
 
435 aa  226  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.73 
 
 
430 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.72 
 
 
426 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0711  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.23 
 
 
423 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.72 
 
 
426 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>