12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2993 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  948    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  27.04 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  25.5 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  24.8 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  27.05 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  24.65 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  21.53 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  26.13 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  20.75 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  20 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  17.86 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  22.98 
 
 		 595 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>