18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0844 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0844  putative lipoprotein  100 
 
 		 360 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  30.21 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  29.67 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2460  putative lipoprotein  30.2 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0734  protein of unknown function DUF1214  30.35 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  26.87 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  28.86 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  29.39 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  26.21 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  26.6 
 
 		 798 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  26.51 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6674  soluble lytic murein transglycosylase  28.2 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0555  hypothetical protein  26.57 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.311779  normal  0.0765605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03471  hypothetical protein  24.41 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1118  hypothetical protein  24.82 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0540786  normal  0.375546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3690  hypothetical protein  42.11 
 
 		 151 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 166 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3376  putative lipoprotein  27.82 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00752899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>