34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1110 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1110  acyltransferase family protein  100 
 
 		 347 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000203806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17520  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  27.27 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1850  acyltransferase 3  26.13 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.889698  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3505  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 373 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1350  acyltransferase 3  31.23 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0722258  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1132  acyltransferase 3  28.86 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1109  acyltransferase 3  28.86 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00931964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16030  acetyltransferase, fucose-4-O-acetylase  27.41 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109512  hitchhiker  0.000000313895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4837  acyltransferase 3  26.46 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4097  acyltransferase 3  26.12 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0634  hypothetical protein  28.95 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0434683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1338  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.179099  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1428  acyltransferase 3  26.55 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0465028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5352  acyltransferase 3  24.05 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  0.0147975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0727  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 610 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0834158 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2348  acyltransferase 3  25.85 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1936  acyltransferase 3  27.49 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0364  hypothetical protein  22.75 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.018012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1362  Fucose 4-O-acetylase and related acetyltransferase-like protein  26.06 
 
 		 675 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1776  acyltransferase 3  32.82 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29944  predicted protein  23.84 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0199  acyltransferase family protein  22.89 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000876664  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26322  predicted protein  22.17 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0849  acyltransferase 3  22.03 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0298936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0199  acyltransferase  22.89 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00737007  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  21.45 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1478  acyltransferase 3  25.59 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.120403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  29.85 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1534  GumF protein  24.71 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274093  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1544  acyltransferase 3  45.28 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01397  exopolysaccharide xanthan biosynthesis acetyltransferase GumG  32.53 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  29.28 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  23.64 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>