22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01590 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  47.81 
 
 
791 aa  644    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01590  conserved hypothetical protein  100 
 
 
838 aa  1688    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31513  predicted protein  41.11 
 
 
756 aa  442  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35246  predicted protein  51.83 
 
 
668 aa  326  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0592899  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13192  predicted protein  72.6 
 
 
74 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  42.86 
 
 
712 aa  79.3  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41981  predicted protein  38.14 
 
 
99 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315481  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  31.07 
 
 
328 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  36.27 
 
 
180 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_6839  predicted protein  35.05 
 
 
101 aa  58.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43387  predicted protein  38.46 
 
 
115 aa  58.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9540  predicted protein  29.35 
 
 
97 aa  54.3  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177599  normal  0.685809 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40769  predicted protein  37.97 
 
 
102 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0145425  normal  0.460561 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8749  predicted protein  34.12 
 
 
109 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08377  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  32 
 
 
288 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247587  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14143  predicted protein  28.42 
 
 
102 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07174  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  30.77 
 
 
305 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643653  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15516  predicted protein  35.9 
 
 
103 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0761412  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_9404  predicted protein  30.43 
 
 
96 aa  48.9  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386241  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67483  predicted protein  32.05 
 
 
657 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15016  predicted protein  35.29 
 
 
119 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00200  nucleolus protein, putative  40.35 
 
 
607 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>