22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02560 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  100 
 
 		 1151 aa  2330    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  52.2 
 
 		 1411 aa  227  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  29.64 
 
 		 1562 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  38.42 
 
 		 906 aa  115  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  35.15 
 
 		 665 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  32.7 
 
 		 1067 aa  102  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  35.29 
 
 		 806 aa  101  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  34.94 
 
 		 732 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  29.9 
 
 		 591 aa  94  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.287043 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  31.32 
 
 		 625 aa  94  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  26.97 
 
 		 1191 aa  89.4  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  29.5 
 
 		 1236 aa  69.7  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  26.69 
 
 		 464 aa  64.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44196  bud-emergence protein  25.45 
 
 		 1747 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  27.22 
 
 		 1100 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02710  Rho GTPase activator, putative  26.97 
 
 		 1296 aa  55.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06260  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 		 810 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272124  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07576  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  28.29 
 
 		 1201 aa  52.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.230213  normal  0.583804 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  27.98 
 
 		 898 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01377  intermediate filament, regulator of G-protein signaling (Eurofung)  26.83 
 
 		 1224 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  24.75 
 
 		 1119 aa  45.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02590  phospholipid binding protein, putative  47.22 
 
 		 1053 aa  44.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>