23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03540 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  100 
 
 
732 aa  1501    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  30.47 
 
 
1067 aa  178  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  38.24 
 
 
665 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  33.94 
 
 
806 aa  123  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  32.02 
 
 
1191 aa  109  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  31.77 
 
 
591 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  34.94 
 
 
1151 aa  100  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  35.39 
 
 
1100 aa  95.1  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  31.19 
 
 
1411 aa  91.3  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07576  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  27.92 
 
 
1201 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.230213  normal  0.583804 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  28.57 
 
 
906 aa  75.1  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  29.73 
 
 
625 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02710  Rho GTPase activator, putative  26.32 
 
 
1296 aa  73.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10999  actin polymerization protein Bzz1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01200)  43.86 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.551222  normal  0.946602 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  29.94 
 
 
1562 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  23.03 
 
 
1119 aa  65.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44196  bud-emergence protein  28.57 
 
 
1747 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03150  hypothetical protein  24.23 
 
 
367 aa  51.2  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06260  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 
810 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272124  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  26.79 
 
 
644 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81215  predicted protein  36.11 
 
 
1080 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.932909 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  24.24 
 
 
1236 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05677  RhoGAP and Fes/CIP4 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04300)  25 
 
 
890 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0427637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>