20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03250 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG03250  Rho GTPase activator, putative  100 
 
 
464 aa  949    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07650  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  45.91 
 
 
1236 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00375231  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91378  GTPase activating protein (GAP) for RHO  46.56 
 
 
644 aa  134  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.962862  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66424  Rho-type GTPase-activating protein  22.05 
 
 
1191 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  26.69 
 
 
1151 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05787  Rho GTPase activator (Bem3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06400)  27.56 
 
 
1411 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66478  predicted protein  27.92 
 
 
1562 aa  67.4  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01025  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  21.76 
 
 
1067 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03746  Rho GTPase activator (Bem2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04450)  24.67 
 
 
625 aa  63.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06490  Rho GTPase activator, putative  26.09 
 
 
906 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04745  hypothetical protein similar to Rho GTPase activating protein (Eurofung)  23.9 
 
 
665 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.993883  normal  0.20139 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66353  cortical Rho GTPase activating protein  25.46 
 
 
591 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01350  GTPase activating protein, putative  22.42 
 
 
806 aa  54.7  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.749698  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74324  predicted protein  25.76 
 
 
1119 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000849527 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02710  Rho GTPase activator, putative  25.82 
 
 
1296 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06260  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
810 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.272124  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44196  bud-emergence protein  26.09 
 
 
1747 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03540  signal transducer, putative  21.43 
 
 
732 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07576  conserved hypothetical protein similar to Rho GTPase activating proteins (Eurofung)  22.75 
 
 
1201 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.230213  normal  0.583804 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02770  glucosamine 6-phosphate N-acetyltransferase, putative  22.17 
 
 
1100 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>