17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00910 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE00910  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  100 
 
 		 932 aa  1892    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.752282  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08291  AP-3 complex subunit delta, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03640)  34.25 
 
 		 934 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.258771  hitchhiker  0.0000000134894 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42302  predicted protein  35.36 
 
 		 622 aa  298  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110936  hitchhiker  0.00027641 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44719  predicted protein  28.07 
 
 		 895 aa  273  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00567496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54028  predicted protein  31.34 
 
 		 1277 aa  267  5.999999999999999e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.214816  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04207  AP-1 adaptor complex subunit gamma, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06030)  22.45 
 
 		 839 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13511  predicted protein  23.53 
 
 		 939 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39338  predicted protein  25.92 
 
 		 630 aa  101  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109278  normal  0.0495163 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01870  gamma-adaptin, putative  25.88 
 
 		 854 aa  98.2  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.543816  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24457  predicted protein  23 
 
 		 829 aa  93.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686631  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16891  predicted protein  24.94 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82880  predicted protein  21.89 
 
 		 812 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07016  AP-2 adaptor complex subunit alpha, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04310)  22.02 
 
 		 935 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_278  predicted protein  22.06 
 
 		 971 aa  75.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.385886 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48152  predicted protein  22.06 
 
 		 979 aa  75.1  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0169632 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54442  predicted protein  27.25 
 
 		 1019 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.595032  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00660  vesicle-mediated transport-related protein, putative  20.07 
 
 		 1063 aa  64.3  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>