More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04230 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04230  conserved hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  495  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32725  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04780  carbonic anhydrase protein, putative  38.33 
 
 
236 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360959  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1335  Carbonate dehydratase  37.32 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0709099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4203  carbonate dehydratase  34.63 
 
 
220 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000488965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3223  putative carbonic anhydrase protein  36.67 
 
 
211 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  35.02 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  34.84 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  35.27 
 
 
206 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3665  carbonate dehydratase  36.41 
 
 
217 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.148403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  36.45 
 
 
204 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03010  putative carbonic anhydrase protein  36.74 
 
 
214 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1839  carbonic anhydrase  35.29 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.885285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1426  carbonic anhydrase  35.29 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1646  carbonate dehydratase  35 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2257  carbonate dehydratase  35 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  35.81 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2281  carbonate dehydratase  35 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.710265  normal  0.440808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1281  putative carbonic anhydrase  35.21 
 
 
211 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1052  carbonic anhydrase  35.21 
 
 
211 aa  129  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00282225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0746  carbonic anhydrase  35.21 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1288  putative carbonic anhydrase  35.21 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0403  putative carbonic anhydrase  35.21 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  34.93 
 
 
223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1120  carbonic anhydrase  35.21 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.522446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  35.98 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05611  carbonic anhydrase Nce103, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11250)  36.36 
 
 
212 aa  128  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0148146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2700  carbonate dehydratase  35.35 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  34.2 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5585  carbonate dehydratase  35.05 
 
 
213 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691086  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  35.27 
 
 
215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  32.88 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  36.28 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  34.11 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  33.94 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  34.17 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  35.27 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  34.58 
 
 
203 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  34.88 
 
 
218 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  34.7 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  34.12 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  35.51 
 
 
201 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  35.16 
 
 
210 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  32.42 
 
 
220 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  33.77 
 
 
226 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2174  carbonate dehydratase  35.05 
 
 
213 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  34.58 
 
 
205 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  35 
 
 
201 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  35 
 
 
201 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2296  carbonate dehydratase  35.05 
 
 
213 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  34.4 
 
 
205 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  34.4 
 
 
205 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  34.4 
 
 
205 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0070  carbonate dehydratase  35.16 
 
 
208 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  34.88 
 
 
226 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  34.4 
 
 
205 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  36.15 
 
 
196 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  34.88 
 
 
226 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  32.43 
 
 
207 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  33.48 
 
 
201 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  36.53 
 
 
209 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  32.13 
 
 
223 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  34.72 
 
 
217 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  34.42 
 
 
209 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  34.29 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5990  carbonate dehydratase  32.16 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000572555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  33.93 
 
 
214 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  34.27 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5677  carbonate dehydratase  32.29 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  33.04 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3778  carbonate dehydratase  33.33 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4370  carbonate dehydratase  31.98 
 
 
220 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  33.8 
 
 
210 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  33.33 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3841  carbonate dehydratase  32.87 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  33.04 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1508  Carbonate dehydratase  33.64 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689145  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  33.33 
 
 
222 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  33.49 
 
 
213 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1020  carbonate dehydratase  36.06 
 
 
207 aa  118  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.870434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  33.49 
 
 
213 aa  118  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  32.44 
 
 
220 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  33.18 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  32.74 
 
 
310 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  34.48 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  32.74 
 
 
291 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  33.04 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  36.57 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  34.91 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  31.58 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  33.64 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  31.74 
 
 
220 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  33.18 
 
 
219 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  34.53 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1403  Carbonate dehydratase  32.11 
 
 
205 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>