30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03420 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03420  Hob1p, putative  100 
 
 
433 aa  902    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.233643  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02516  actin-associated protein (Eurofung)  40.41 
 
 
408 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219609  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67177  predicted protein  33.78 
 
 
438 aa  258  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07760  SH3 domain signalling protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07670)  23.82 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448426  normal  0.219006 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30020  predicted protein  25.11 
 
 
404 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201529  normal  0.620116 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50804  predicted protein  25.31 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  42.11 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86838  predicted protein  26.69 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08831  amphiphysin-like lipid raft protein (Eurofung)  26.97 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  45.28 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70032  predicted protein  33.68 
 
 
612 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10442  Rho guanyl nucleotide exchange factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04600)  19.2 
 
 
1921 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04860  protein hob3, putative  22.97 
 
 
245 aa  60.1  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02066  Class E vacuolar protein-sorting machinery protein hse1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL4]  35.11 
 
 
581 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02130  cell division control protein Cdc25, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16240)  42.86 
 
 
1241 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02995  SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08620)  32.48 
 
 
253 aa  56.6  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
663 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11147  conserved hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000131571 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00910  glycosyl transferase, putative  31.51 
 
 
660 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30867  predicted protein  35.53 
 
 
288 aa  50.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32905  predicted protein  43.14 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0302596  normal  0.166327 
 
 
-
 
NC_006686  CND04880  hypothetical protein  38.6 
 
 
693 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.693409  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04496  polarized growth protein (Boi2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03360)  37.7 
 
 
996 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755844  normal  0.139277 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82711  SH3 domain protein involved in assembly of cortical actin cytoskeleton  37.7 
 
 
1151 aa  47.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.34948  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01462  cytoskeleton assembly control protein Sla1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04520)  35.59 
 
 
1122 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194232  normal  0.210772 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10999  actin polymerization protein Bzz1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01200)  32.84 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.551222  normal  0.946602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08210  SH3 domain protein (Cyk3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03400)  34.48 
 
 
1789 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321233  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01840  cell division control protein 25, putative  43.14 
 
 
1368 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80641  predicted protein  36.21 
 
 
606 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03080  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 
611 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>