28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04880 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND04880  hypothetical protein  100 
 
 
693 aa  1364    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.693409  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11147  conserved hypothetical protein  42.96 
 
 
118 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000131571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11139  actin binding protein (Eurofung)  39.67 
 
 
550 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.575346  hitchhiker  0.000000252521 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80641  predicted protein  32.31 
 
 
606 aa  75.5  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02130  cell division control protein Cdc25, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16240)  39.33 
 
 
1241 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70032  predicted protein  29.05 
 
 
612 aa  63.9  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02066  Class E vacuolar protein-sorting machinery protein hse1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBL4]  42.42 
 
 
581 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03630  protein binding protein, putative  26.54 
 
 
1978 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326559  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32905  predicted protein  28.65 
 
 
475 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0302596  normal  0.166327 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30867  predicted protein  40 
 
 
288 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  37.66 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01840  cell division control protein 25, putative  36.49 
 
 
1368 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00910  glycosyl transferase, putative  38.57 
 
 
660 aa  55.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30020  predicted protein  31.03 
 
 
404 aa  54.7  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.201529  normal  0.620116 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  36.84 
 
 
399 aa  53.9  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02400  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  45.1 
 
 
1210 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02516  actin-associated protein (Eurofung)  44.23 
 
 
408 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219609  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00930  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 
147 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.264395  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04963  cell division control protein (Cdc15), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10250)  37.5 
 
 
1057 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00898549  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01462  cytoskeleton assembly control protein Sla1, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04520)  25.93 
 
 
1122 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194232  normal  0.210772 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67177  predicted protein  42.42 
 
 
438 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03860  actin filament organization-related protein, putative  36.59 
 
 
276 aa  48.9  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02590  phospholipid binding protein, putative  40.38 
 
 
1053 aa  48.5  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07760  SH3 domain signalling protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07670)  30.53 
 
 
455 aa  47.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448426  normal  0.219006 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03420  Hob1p, putative  38.6 
 
 
433 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.233643  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82711  SH3 domain protein involved in assembly of cortical actin cytoskeleton  24.39 
 
 
1151 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.34948  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02995  SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08620)  28.99 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03080  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
611 aa  44.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>