122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2341 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2341  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.957901  normal  0.854034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0462  hypothetical protein  38.95 
 
 
202 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.086109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3758  protein of unknown function DUF151  39.78 
 
 
200 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16268  hitchhiker  0.00121907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2212  hypothetical protein  40.2 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000965632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0848  protein of unknown function DUF151  39.78 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0513617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0668  protein of unknown function DUF151  37.37 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3873  protein of unknown function DUF151  39.13 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0354  hypothetical protein  37.23 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2044  protein of unknown function DUF151  40 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248779  hitchhiker  0.00000000029201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0328  protein of unknown function DUF151  35.79 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000184753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0115  hypothetical protein  38.04 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0711  protein of unknown function DUF151  37.63 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1242  protein of unknown function DUF151  39.78 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13288  hypothetical protein  39.58 
 
 
206 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0397  protein of unknown function DUF151  35.48 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00160874  hitchhiker  0.0000295768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1111  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000542394  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1875  hypothetical protein  36.96 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.653331  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0530  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000860812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0431  protein of unknown function DUF151  33.68 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.741261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_495  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000100237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0836  hypothetical protein  34.04 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1844  protein of unknown function DUF151  37.11 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1472  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0431  protein of unknown function DUF151  36.56 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000235563  normal  0.0443152 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1753  hypothetical protein  34.41 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0351861  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2337  protein of unknown function DUF151  35.35 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1396  hypothetical protein  34.34 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0395  hypothetical protein  33.68 
 
 
219 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000988242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4358  hypothetical protein  29.84 
 
 
178 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.305208  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1192  protein of unknown function DUF151  30 
 
 
202 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2842  hypothetical protein  36.56 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2886  hypothetical protein  36.56 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.263625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2873  hypothetical protein  36.56 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1361  hypothetical protein  38.54 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183231  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3094  protein of unknown function DUF151  38.61 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.094995  normal  0.0102685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3400  hypothetical protein  36.56 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765241  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1543  hypothetical protein  36.56 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3133  hypothetical protein  36.56 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0655971 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0037  protein of unknown function DUF151  32.32 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.210982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1415  hypothetical protein  31.63 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1470  hypothetical protein  34.34 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2763  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1050  hypothetical protein  31.37 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.931786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1544  protein of unknown function DUF151  36.56 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00135438 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11859  hypothetical protein  35.79 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.543843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4995  hypothetical protein  34.34 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0313  protein of unknown function DUF151  34.74 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1884  protein of unknown function DUF151  38.95 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0010  protein of unknown function DUF151  35.14 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000315658 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1590  protein of unknown function DUF151  32.98 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241237  normal  0.830999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1471  protein of unknown function DUF151  31.68 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2354  hypothetical protein  33 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2055  protein of unknown function DUF151  33.33 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0271607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0719  electron transport complex, RnfABCDGE type, A subunit  33.04 
 
 
360 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0600107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2136  protein of unknown function DUF151  33.68 
 
 
191 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000450103 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2219  protein of unknown function DUF151  34.34 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000646994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22570  hypothetical protein  32.67 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309185  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0928  hypothetical protein  32.69 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.596114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2711  hypothetical protein  32 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403135  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1176  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4008  protein of unknown function DUF151  32.76 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.680842  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3741  hypothetical protein  34.41 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4387  protein of unknown function DUF151  33.33 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2432  protein of unknown function DUF151  31.68 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000101682  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1975  hypothetical protein  33.65 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1331  protein of unknown function DUF151  32.29 
 
 
242 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2071  hypothetical protein  32.38 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0573597  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1740  protein of unknown function DUF151  34.74 
 
 
184 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.2629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0858  protein of unknown function DUF151  31.13 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2724  protein of unknown function DUF151  30 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1128  protein of unknown function DUF151  25.69 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0003  protein of unknown function DUF151  29.81 
 
 
238 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.694021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0418  hypothetical protein  27 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2379  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200246  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1224  hypothetical protein  29 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.414379  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0856  hypothetical protein  31.73 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.323862  normal  0.663691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1219  protein of unknown function DUF151  29.59 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1249  protein of unknown function DUF151  29.59 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0107  hypothetical protein  33.88 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.787303  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0777  hypothetical protein  36.27 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0261295  hitchhiker  0.00887268 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2435  protein of unknown function DUF151  30.48 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2100  protein of unknown function DUF151  35.42 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5354  protein of unknown function DUF151  32.26 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2773  protein of unknown function DUF151  32.97 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.303456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0308  protein of unknown function DUF151  30.61 
 
 
235 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274422 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0008  protein of unknown function DUF151  34.69 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.756482  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0693  hypothetical protein  29.82 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1780  hypothetical protein  32.67 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3130  protein of unknown function DUF151  34.07 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1515  hypothetical protein  31.52 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2568  hypothetical protein  29.59 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.334798  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0868  protein of unknown function DUF151  30.85 
 
 
191 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000608539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5941  protein of unknown function DUF151  28.42 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1071  hypothetical protein  27 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.208714  hitchhiker  0.00414947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2460  hypothetical protein  28.42 
 
 
166 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2518  hypothetical protein  30.39 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000889527 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0036  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0242  protein of unknown function DUF151  27.55 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0495008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0919  protein of unknown function DUF151  27.37 
 
 
180 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0821  protein of unknown function DUF151  29.03 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.501387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>