208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1588 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1588  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0980285  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2185  tRNA-Lys  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2181  tRNA-Lys  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2216  tRNA-Lys  94.67 
 
 		 78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2262  tRNA-Lys  94.67 
 
 		 78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.11111  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0597  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.215677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0600  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212057  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1162  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0178248  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.590249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1159  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00817657  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1737  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000166556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1740  tRNA-Lys  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000195232  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0509  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0512  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.299148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0515  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.317798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0017  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0021  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07679  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.342571  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0031  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0843462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07677  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0030  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0035  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221382  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt42  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000411683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0066  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00163637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00102646  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000192753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000169061  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0018  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000535149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0061  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000544975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_R0080  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000523506  normal  0.960372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1474  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000230353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3561  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000191546  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_R0080  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161915  normal  0.0753371 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1909  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0085  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000813778  normal  0.199045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0014  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0016  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000072024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0026  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000721993  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0074  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000283868  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0002  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000230131  normal  0.891298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0078  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000293807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0020  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2046  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000148192  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1097  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000222375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2897  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3094  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0018  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000206561  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0073  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000270746  normal  0.313667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0039  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000372994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0054  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00610813  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0065  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00130991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0072  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00108328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0084  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.011536  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0084  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000150317  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0045  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00337012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0089  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000256192  normal  0.667344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0066  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000012861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0008  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000162248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0018  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000054904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0066  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000013609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_R0083  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000284492  normal  0.0190641 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_R0089  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000671858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0067  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000342339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0074  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000244409  normal  0.0967711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0008  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000320674  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0002  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000350772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0630  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000358951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0015  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1168  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0005  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000238444  hitchhiker  0.00232572 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3108  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0029  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856201  normal  0.110623 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0004  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000259664  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0928  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000151896  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_R0086  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00192054  normal  0.222776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0701  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000189505  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1988  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1329  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00168049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0008  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000588421  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3542  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000176081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3771  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0592  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000232315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0068  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00409998  normal  0.989602 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1338  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0008  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000057539  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3568  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0990712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3832  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0495  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0002  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0904  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0066867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>