51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1458 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1458  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000874188  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2208  tRNA-Val  91.67 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2130  tRNA-Val  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  92.86 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2580  tRNA-Val  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0938444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0075  tRNA-Val  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00433017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0076  tRNA-Val  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00448767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4230  tRNA-Val  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000689927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4229  tRNA-Val  92.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000067821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1533  tRNA-Val  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.102488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1556  tRNA-Val  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1519  tRNA-Val  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000581354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1751  tRNA-Val  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000295955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1920  tRNA-Val  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0104306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0077  tRNA-Val  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00426255  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0026  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2581  tRNA-Val  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0567199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4228  tRNA-Val  92.11 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0055  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0051  tRNA-Val  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0010  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.239466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0061  tRNA-Val  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt39  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1184  tRNA-Val  86 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt39  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0780  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>