166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0061 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0780  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1184  tRNA-Val  93.75 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt39  tRNA-Val  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt39  tRNA-Val  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0026  tRNA-Val  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1570  tRNA-Val  92.16 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.736418  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1888  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1133  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.646427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0012  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000181787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0339  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0351781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2596  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0006  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0001  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0026  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000276019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna32  tRNA-Val  85.07 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0004  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0580435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28190  tRNA-Val  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.018303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0004  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0212233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0004  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105423  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0039  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1541  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.713195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0004  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0203  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00945827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1710  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713691  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2904  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1734  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2749  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0961  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0032972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2457  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0076  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.083212  hitchhiker  0.00562166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0039  tRNA-Val  85.07 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0041  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0075941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0040  tRNA-Val  85.07 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0001  tRNA-Val  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00027  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.825713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1520  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00188804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0054  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.322484  hitchhiker  0.000000167745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0048  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000092114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t55  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t56  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS05795  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t34  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0987104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t35  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0521138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA41  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA42  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191671  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0010  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0021  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0026  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.211344  normal  0.0167997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0017  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00286264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R39  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0141809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0049  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00100813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0010  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00245461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0027  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0032  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.100652  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0050  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0857362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0015  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000941457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0080  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217837  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0033  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0041  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352531  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0056  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.389375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0045  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1750  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307379  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1557  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.939336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2378  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000316536  hitchhiker  0.00924941 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1713  tRNA-Val  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.205594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1919  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0016  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0039  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0358134  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0042  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.921175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0054  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1534  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0495924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0045  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0046  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0047  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.877588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0022  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.766553  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0020  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.649475  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1532  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000254029  hitchhiker  0.00110314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0046  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0032  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0071  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0029  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0053  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0699636  normal  0.799268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0054  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0691597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0054  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0041  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0025  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4667  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2148  tRNA-Val  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000010936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5035  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158599  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0076  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0070  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0042  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0043  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0045  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00877282  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0045  tRNA-Val  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.431879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>