60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0056 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0056  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.389375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-1  tRNA-Val  89.39 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_163  tRNA-Val  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0004  tRNA-Val  92.59 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0021  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.357184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0021  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0029  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0059  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2266  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3052  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.728072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2650  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2705  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1539  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.051003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0038  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.827791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0025  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0061  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.700263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0061  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0061  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0089  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Val-4  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.464554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0051  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353155  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2783  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0812706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1831  tRNA-Val  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0069  tRNA-Val  86.57 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00232154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0036  tRNA-Val  86.96 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  85.07 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0039  tRNA-Val  85.07 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.867547  hitchhiker  0.000112761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0017  tRNA-Val  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.598097  normal  0.464383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0026  tRNA-Val  88.24 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0048  tRNA-Val  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.546388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0054  tRNA-Val  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0038  tRNA-Val  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0036  tRNA-Val  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.012717  normal  0.28653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0050  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651338  normal  0.744651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0061  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0050  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.568856  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0007  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0174963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0012  tRNA-Val  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6005  tRNA-Val  83.58 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.859444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0021  tRNA-Val  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  84.75 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  87.93 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  87.93 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  86.96 
 
 		 81 bp  44.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  87.93 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>