39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0682 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  100 
 
 
140 aa  273  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.14 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  40 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.86 
 
 
140 aa  96.7  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.78 
 
 
140 aa  84.3  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.13 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.86 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.72 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.3 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.01 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.53 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.91 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  27.68 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.04 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  29.46 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  21.95 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.48 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  23.14 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.59 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.88 
 
 
171 aa  41.6  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.46 
 
 
156 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.68 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  25.66 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 
163 aa  40.8  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  26.55 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  23.93 
 
 
156 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  23.93 
 
 
156 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  23.93 
 
 
156 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>