22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0887 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0887  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182556  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1091  biopolymer transport ExbB protein  41.85 
 
 
227 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1264  hypothetical protein  39.52 
 
 
226 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.720541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0918  hypothetical protein  41.15 
 
 
221 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1448  hypothetical protein  37.91 
 
 
205 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000174999  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0393  hypothetical protein  39.13 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1449  hypothetical protein  36.09 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000025878  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1074  hypothetical protein  32.96 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0779  hypothetical protein  21.69 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.338877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0735  hypothetical protein  23.31 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0198951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0772  hypothetical protein  24.51 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0772  hypothetical protein  24.51 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  28.68 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  32.04 
 
 
302 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  28.68 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  27.2 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5119  NLP/P60 protein  30.93 
 
 
387 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.553866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4116  hypothetical protein  20.55 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  29.52 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4000  hypothetical protein  22.22 
 
 
262 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>