17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2071 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2071  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  869    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0112  hypothetical protein  61.52 
 
 
442 aa  518  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  39.26 
 
 
441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0912  hypothetical protein  39.46 
 
 
443 aa  330  2e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.214315  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  38.79 
 
 
483 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  38.79 
 
 
480 aa  316  5e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  38.32 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1219  hypothetical protein  33.57 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1216  hypothetical protein  33.91 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0162569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  45.1 
 
 
550 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  45.1 
 
 
550 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  45.1 
 
 
550 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  38.03 
 
 
520 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  43.64 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  32.79 
 
 
708 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  29.58 
 
 
706 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  27.78 
 
 
696 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>