59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0223 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  100 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  78.05 
 
 		 205 aa  291  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  52.94 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  45.09 
 
 		 187 aa  151  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  43.89 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  45.09 
 
 		 187 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  45.09 
 
 		 190 aa  148  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  37.1 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  42.62 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  37.28 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  27.88 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  29.25 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  32.31 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  35.45 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  30.82 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  30.82 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  30.82 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  30.41 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  34.55 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  29.93 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  32.73 
 
 		 162 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  30.41 
 
 		 164 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  29.05 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  28.92 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  25.93 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  27.84 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  29.05 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  29.05 
 
 		 164 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  29.68 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  29.58 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  22.99 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  25.69 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  24.86 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  26.52 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.68 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  27.22 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.85 
 
 		 166 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  22.28 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  23.97 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  23.95 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  30.28 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  27.27 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  30.77 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  28.97 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  28.87 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  23.19 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  22.53 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  23.21 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  23.76 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  29.93 
 
 		 169 aa  42  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  28.87 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  31.13 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  25.99 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>