59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_A0019 on replicon NC_009726
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  100 
 
 
164 aa  341  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  50.64 
 
 
154 aa  163  8e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  40.94 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  40.27 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  40.27 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  40.27 
 
 
159 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  39.6 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  38.93 
 
 
158 aa  103  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  38.93 
 
 
158 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  35.4 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  36.42 
 
 
146 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  35.76 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  33.77 
 
 
154 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  33.77 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  35.58 
 
 
155 aa  87  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  33.77 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  33.77 
 
 
154 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  35.67 
 
 
152 aa  86.3  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  36.42 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  36.42 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  36.42 
 
 
149 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  33.11 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  30.73 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  33.99 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  29.01 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  29.67 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  31.87 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  30.72 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  27.78 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  28.21 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  31.21 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  30.25 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  31.43 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  28.86 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  30.77 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  34.72 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  26.71 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  33.82 
 
 
128 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  28.49 
 
 
155 aa  55.5  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  26.67 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  30.87 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  33.94 
 
 
125 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  24.16 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  30.07 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 
298 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
300 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
300 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
300 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
300 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
300 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 
300 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 
300 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
300 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 
300 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
300 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  23.68 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>