39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12788 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  814    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  41.88 
 
 		 395 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  36.97 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  34.05 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  30.81 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  31.52 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  30.17 
 
 		 355 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  30.95 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  28.09 
 
 		 369 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  30.12 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  30.38 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  30.09 
 
 		 357 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  29.07 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  29.79 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  29.41 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  27.61 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  28.61 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  27 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.86 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  26.15 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  24.72 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  24.08 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  24.43 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  22.29 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  27.1 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  26.17 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1002 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  20.29 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1088 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1041 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  23.35 
 
 		 983 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  21.54 
 
 		 978 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1088 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  19.71 
 
 		 978 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  20.87 
 
 		 950 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  19.71 
 
 		 978 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  19.83 
 
 		 978 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  20.69 
 
 		 981 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1009 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>