17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04850 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04850  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.85439  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01790  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  28.95 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2495  hypothetical protein  23.15 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0476842  normal  0.144601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3552  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.97 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1383  amino acid exporter, putative  27.54 
 
 
212 aa  52  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0228718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3701  hypothetical protein  22.58 
 
 
215 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.364527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1030  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.89 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0550484  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0991  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.13 
 
 
208 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4052  lysine exporter protein LysE/YggA  23.49 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3107  LysE family protein  25.32 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3023  LysE family translocator protein  25.32 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.917824  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1153  conserved hypothetical integral membrane protein, putative transporter, LysE family  30.89 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000661162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2152  LysE family protein  26.14 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2023  LysE family translocator protein  26.14 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2590  LysE family translocator protein  26.14 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0757  LysE family translocator protein  26.14 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3076  LysE family translocator protein  25.49 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.331488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>