12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1386 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1386  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  617  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5690  type IV pilus assembly PilZ  25.99 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_003296  RS03149  hypothetical protein  24.44 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.0284189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4176  type IV pilus assembly PilZ  22.37 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4288  type IV pilus assembly PilZ  22.37 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0575819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  26.82 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1142  type IV pilus assembly PilZ  21.77 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2279  hypothetical protein  19.8 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  22.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  22.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 375 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0639  type IV pilus assembly PilZ  24.43 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>