17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1015 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1015    100 
 
 		 351 bp  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000847594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  87.14 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  87.14 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  87.14 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    87.14 
 
 		 2389 bp  67.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  85.71 
 
 		 876 bp  60  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  100 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  100 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  100 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  100 
 
 		 855 bp  52  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7300    84.62 
 
 		 562 bp  50.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130484  hitchhiker  0.00884242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 900 bp  48.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    96.43 
 
 		 324 bp  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 		 900 bp  48.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 13290 bp  46.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    93.55 
 
 		 216 bp  46.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  91.43 
 
 		 936 bp  46.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>