23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2014 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2014  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0101545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5907  hypothetical protein  55.8 
 
 
138 aa  157  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  33.57 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5647  Universal stress protein UspA family  37.14 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1591  hypothetical protein  32.86 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1204  hypothetical protein  33.57 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1130  hypothetical protein  33.79 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4084  hypothetical protein  32.64 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4548  hypothetical protein  32.64 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5610  hypothetical protein  34.48 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.237304  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4002  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4690  hypothetical protein  33.79 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839166  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1487  UspA family protein  32.64 
 
 
177 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.976607  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3677  hypothetical protein  33.8 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252461  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1322  UspA family protein  32.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2508  UspA family protein  32.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0987  UspA family protein  32.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1249  hypothetical protein  32.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0580  UspA family protein  32.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0304  UspA family protein  32.64 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1322  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  26.57 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>