More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0739 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4497  acetyl-CoA acetyltransferase  82.86 
 
 
394 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509306  normal  0.249354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4419  acetyl-CoA acetyltransferase  93.92 
 
 
395 aa  745    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0739  thiolase  100 
 
 
395 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100199  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3058  acetyl-CoA acetyltransferase  76.73 
 
 
394 aa  624  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1953  acetyl-CoA acetyltransferase  73.98 
 
 
395 aa  609  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0102019  normal  0.550682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7471  acetyl-CoA acetyltransferase  77.18 
 
 
392 aa  594  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.818426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4738  thiolase  71.25 
 
 
394 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2706  acetyl-CoA acetyltransferases  70.99 
 
 
394 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.21761  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  69.57 
 
 
394 aa  554  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 
402 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
394 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
394 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
393 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
395 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
393 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
392 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
393 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  48.7 
 
 
393 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
392 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
393 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  45.9 
 
 
393 aa  365  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
393 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
396 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
394 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
392 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
393 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
393 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
393 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  46.97 
 
 
394 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
392 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 
391 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
392 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  46.72 
 
 
394 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  359  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
391 aa  358  9e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  44.56 
 
 
392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
393 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  48.6 
 
 
394 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.34 
 
 
396 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  48.6 
 
 
394 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.09 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
393 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 
394 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
393 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  48.99 
 
 
427 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  48.98 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  48.98 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  48.98 
 
 
394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  48.74 
 
 
427 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  48.74 
 
 
427 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
393 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  48.48 
 
 
394 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  48.73 
 
 
394 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  48.85 
 
 
394 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  49.11 
 
 
394 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
395 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
393 aa  349  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  45.62 
 
 
391 aa  349  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  349  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 
392 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  47.21 
 
 
394 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  44.19 
 
 
398 aa  348  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  49.11 
 
 
394 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.67 
 
 
393 aa  348  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
401 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
392 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
393 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 
392 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
390 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 
392 aa  345  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
393 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
394 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>