14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1779 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1779  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2574  hypothetical protein  71.95 
 
 
230 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960669  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6485  hypothetical protein  69.57 
 
 
230 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.32535  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0238  hypothetical protein  70.54 
 
 
234 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0474  hypothetical protein  69.06 
 
 
234 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.772079 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  27.95 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  26.98 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  24.55 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  25.76 
 
 
302 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1733  chromosome partitioning ATPase  40.43 
 
 
419 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.635765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  28.16 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  28.16 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  30.38 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  28.16 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>