41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0770 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0770  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4678  hypothetical protein  66.98 
 
 
123 aa  153  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0864136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6221  protein of unknown function DUF190  42.31 
 
 
120 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0580477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56970  hypothetical protein  37.14 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0771  hypothetical protein  43.27 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4676  hypothetical protein  40.91 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.169343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1126  hypothetical protein  34.86 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1947  hypothetical protein  31.73 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12973  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4618  hypothetical protein  36.54 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1484  hypothetical protein  36.54 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0811  hypothetical protein  31.07 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2525  hypothetical protein  31.73 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5577  hypothetical protein  37.74 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1487  hypothetical protein  31 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4620  hypothetical protein  31 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1755  hypothetical protein  29.91 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2590  hypothetical protein  34.02 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1563  hypothetical protein  29.81 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1037  hypothetical protein  30.1 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.271549  normal  0.172234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06122  hypothetical protein  32.05 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01044  hypothetical protein  32.05 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4048  hypothetical protein  29.91 
 
 
116 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0715  protein of unknown function DUF190  33.75 
 
 
125 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12794e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0703  protein of unknown function DUF190  33.75 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0909  hypothetical protein  28.97 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0947  hypothetical protein  28.97 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0456  protein of unknown function DUF190  27.66 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.86515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0468  hypothetical protein  28.97 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0817  hypothetical protein  28.87 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1259  hypothetical protein  31.08 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.851649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0806  hypothetical protein  28.87 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1521  hypothetical protein  28.57 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000191307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0237  hypothetical protein  35 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.627259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0504  hypothetical protein  32.95 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2283  protein of unknown function DUF190  33.01 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0834  hypothetical protein  31.43 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.858155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2450  hypothetical protein  25 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989009  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2029  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2584  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  40  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0750  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  40  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2159  hypothetical protein  28.87 
 
 
118 aa  40  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>