36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0169 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0169  putative flagellar protein FliT  100 
 
 
108 aa  216  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.370668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3767  putative flagellar protein FliT  96.3 
 
 
108 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.684453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2928  putative flagellar protein FliT  73.39 
 
 
109 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3284  hypothetical protein  65.14 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3397  hypothetical protein  65.14 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0237  hypothetical protein  65.14 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0225  hypothetical protein  65.14 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2139  hypothetical protein  65.14 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2949  hypothetical protein  65.14 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0203  hypothetical protein  63.3 
 
 
108 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3106  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2972  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.124393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3058  hypothetical protein  62.39 
 
 
110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3061  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3080  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2447  hypothetical protein  61.47 
 
 
110 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6410  hypothetical protein  60.55 
 
 
110 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5093  flagellar protein FliT  40.82 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1013  flagellar chaperone  39.56 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5256  putative flagellar protein FliT  34.58 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2863  flagellar chaperone  39.08 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1594  flagellar protein FliT  39.53 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2897  hypothetical protein  37.14 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3809  flagellar protein FliT  35.63 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3083  flagellar protein FliT  35.23 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.88004  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3670  flagellar protein FliT  39.02 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643949  normal  0.821667 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0385  flagellar protein FliT  39.24 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4747  putative flagellar protein FliT  39.02 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.408466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1341  flagellar protein FliT  34.04 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0498438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24270  flagellar protein  43.21 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4397  flagellar protein FliT  35.56 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0621  flagellar protein FliT  33.33 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3139  hypothetical protein  37.37 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal  0.437682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2773  flagellar export chaperone  37.37 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.804206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1893  flagellar biosynthesis protein FliT  29.47 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1538  flagellar export chaperone  32.61 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>