22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5507 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5507  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.467204 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5193  hypothetical protein  32.35 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.264545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5593  hypothetical protein  32.91 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1601  hypothetical protein  29.91 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5242  hypothetical protein  29.91 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1595  hypothetical protein  30.2 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.691344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6237  hypothetical protein  28.69 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6525  hypothetical protein  31.08 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5024  hypothetical protein  29.29 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.541347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1659  hypothetical protein  29.55 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2985  hypothetical protein  27.94 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3824  hypothetical protein  27.16 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0937029  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4296  hypothetical protein  28.34 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.337825 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4407  hypothetical protein  28.28 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5066  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3233  hypothetical protein  25.1 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4312  hypothetical protein  25.14 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0069  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0096  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604451  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0046  hypothetical protein  40 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00092552 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0067  hypothetical protein  33.88 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>