47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5068 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5068  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4298  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.83 
 
 		 281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.232236 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  50.78 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.454327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1603  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.77 
 
 		 266 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6235  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.76 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.918479  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4405  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.36 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.09 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0920215  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5026  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.53 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2536  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.07 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.886692 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6523  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.53 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5595  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.14 
 
 		 275 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1597  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.55 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5191  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.43 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.511652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1657  hypothetical protein  38.85 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2986  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.11 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.76 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.12 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.08 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0069  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.16 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.701248  normal  0.470884 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0191  ThiF family protein  23.08 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0065  ThiF family protein  24.35 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0042  ThiF family protein  24.35 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000190177 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0100  hypothetical protein  24.35 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0405921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.45 
 
 		 379 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1158  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.68 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00601178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0075  thiamine biosynthesis protein ThiF  30.91 
 
 		 202 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0371  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.26 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.9 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.9 
 
 		 199 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33774  ubiquitin-activating enzyme E1, protein 3  28.85 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.17 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2472  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.59 
 
 		 367 aa  45.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  32.74 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  32.74 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.36 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.26 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.57 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0490  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.61 
 
 		 220 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.64 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  27.64 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  25.87 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1682  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.19 
 
 		 207 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000522342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  27.18 
 
 		 264 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>