26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4231 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  100 
 
 		 121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  61.48 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  57.52 
 
 		 267 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  35.92 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.48 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  30.53 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  34.43 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1127  hypothetical protein  36.54 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  33.67 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  27.48 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  39.44 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  29.46 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  31.75 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1617  hypothetical protein  30.7 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  34.92 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1843  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  37.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  38.03 
 
 		 205 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  29.2 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  29.27 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3522  hypothetical protein  29.92 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.97 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>