26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6592 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6592  protein of unknown function DUF1175  100 
 
 
327 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191947  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2574  hypothetical protein  88.68 
 
 
257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.165739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3311  protein of unknown function DUF1175  69.16 
 
 
234 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3031  hypothetical protein  67.7 
 
 
241 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0310566  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2964  protein of unknown function DUF1175  72.6 
 
 
234 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0748303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02114  hypothetical protein  57.59 
 
 
207 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02155  hypothetical protein  57.59 
 
 
207 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1430  protein of unknown function DUF1175  57.89 
 
 
207 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3363  hypothetical protein  57.89 
 
 
207 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1422  hypothetical protein  57.89 
 
 
207 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.12888  hitchhiker  0.0000113323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2524  hypothetical protein  57.89 
 
 
207 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5001  hypothetical protein  61.05 
 
 
212 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521864  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58260  hypothetical protein  60.42 
 
 
212 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5104  hypothetical protein  60.42 
 
 
212 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2369  hypothetical protein  57.37 
 
 
207 aa  259  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2377  hypothetical protein  56.32 
 
 
207 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.280114  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0927  hypothetical protein  33.96 
 
 
283 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1755  hypothetical protein  31.22 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1809  hypothetical protein  31.22 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0138  hypothetical protein  29.53 
 
 
207 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1093  hypothetical protein  32.06 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0056  dehydrogenase subunit  33.33 
 
 
524 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 
3242 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1493  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.33 
 
 
633 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3636  hypothetical protein  39.73 
 
 
262 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.82 
 
 
659 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>