15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6485 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6485  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.32535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0238  hypothetical protein  86.09 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0474  hypothetical protein  83.48 
 
 		 234 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.772079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1779  hypothetical protein  69.57 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2574  hypothetical protein  67.84 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  28.1 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  27.92 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  24.66 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  28.41 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  28.41 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  28.41 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  22.03 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  31.58 
 
 		 449 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  25.11 
 
 		 241 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  29.81 
 
 		 1571 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>