78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2555 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  100 
 
 
309 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  78.21 
 
 
284 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  94.09 
 
 
246 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  78.2 
 
 
283 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  74.91 
 
 
336 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  74.91 
 
 
336 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  78.2 
 
 
272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  77.44 
 
 
286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  76.49 
 
 
283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  77.44 
 
 
286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  78.2 
 
 
272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  78.2 
 
 
272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  77.07 
 
 
286 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  77.82 
 
 
276 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  78.11 
 
 
319 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  77.12 
 
 
285 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  76.83 
 
 
283 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  74.35 
 
 
285 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  62.93 
 
 
280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  62.93 
 
 
280 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  64.6 
 
 
294 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  64.23 
 
 
294 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  61.92 
 
 
283 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  61.27 
 
 
301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  67.05 
 
 
268 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  57.5 
 
 
300 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  61.07 
 
 
273 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  60.82 
 
 
277 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  54.44 
 
 
259 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  54.83 
 
 
265 aa  285  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  58.52 
 
 
276 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  56.87 
 
 
270 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  61.19 
 
 
265 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  56.87 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  56.49 
 
 
268 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  58.94 
 
 
268 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  57.85 
 
 
276 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  54.96 
 
 
276 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  50.93 
 
 
274 aa  254  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  54.17 
 
 
255 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  51.36 
 
 
278 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  59.43 
 
 
264 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  51.56 
 
 
280 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  53.38 
 
 
278 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  50.2 
 
 
278 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  48.47 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  52.86 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  50.49 
 
 
275 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  44.06 
 
 
290 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  45.14 
 
 
275 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  48.39 
 
 
275 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  49.03 
 
 
275 aa  201  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  46.18 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  62.73 
 
 
161 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  47.47 
 
 
275 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  46.15 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  48.29 
 
 
260 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  48.84 
 
 
263 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  43.87 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  42.86 
 
 
264 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  44.81 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  44.8 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  40.61 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1089  hypothetical protein  33.72 
 
 
271 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  35.87 
 
 
267 aa  155  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  39.04 
 
 
446 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1131  hypothetical protein  38.97 
 
 
265 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0607  hypothetical protein  38.18 
 
 
265 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1262  hypothetical protein  38.54 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1256  hypothetical protein  38.18 
 
 
265 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  38.98 
 
 
319 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  34.84 
 
 
270 aa  142  8e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  34.42 
 
 
546 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  39.72 
 
 
268 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  66.07 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  66.07 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  29.86 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  50.51 
 
 
103 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>