18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0455 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0455  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0882929  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0210  hypothetical protein  53.9 
 
 
295 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1507  hypothetical protein  45.49 
 
 
285 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0986  hypothetical protein  34.98 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1530  hypothetical protein  29.19 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.423449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0934  hypothetical protein  28.88 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.395851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  26.74 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  26.16 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  24.78 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4491  hypothetical protein  24.78 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  24.78 
 
 
300 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2168  hypothetical protein  22.76 
 
 
297 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2921  hypothetical protein  24.44 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309842  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04711  hypothetical protein  24.65 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  26.61 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0476  hypothetical protein  20.74 
 
 
346 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2629  hypothetical protein  20.74 
 
 
346 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02030  hypothetical protein  29.5 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>